Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE3BQ13370 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE3BQ13370 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDE3BQ13370 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDE3BQ13370 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE3BQ13370 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
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