Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN3Q13286 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLN3Q13286 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLN3Q13286 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms