Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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