Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms