Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPFIA1Q13136 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA1Q13136 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA1Q13136 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA1Q13136 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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