Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL28Q13084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL28Q13084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms