Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MKRN3Q13064 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKRN3Q13064 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKRN3Q13064 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKRN3Q13064 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
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