Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTP4A2Q12974 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTP4A2Q12974 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTP4A2Q12974 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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