Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRAF2Q12933 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF2Q12933 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF2Q12933 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF2Q12933 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms