Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 PRE5YMR314W 705 nt8.68□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 PZF1YPR186C 1290 nt8.68□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 PSA1YDL055C 1086 nt8.67□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.66□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 CRN1YLR429W 1956 nt8.65□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 YJR142WYJR142W 1029 nt8.65□□□□□ -1.02
SSF2Q12153 MFG1YDL233W 1377 nt8.64□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 STF1YDL130W-A 261 nt8.64□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 EHD3YDR036C 1503 nt8.64□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 AVL9YLR114C 2295 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 YPC1YBR183W 951 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 SDH8YBR269C 417 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 OSM1YJR051W 1506 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 TPO1YLL028W 1761 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 SPS1YDR523C 1473 nt8.63□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 SNU71YGR013W 1863 nt8.62□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 CKB1YGL019W 837 nt8.62□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 GET2YER083C 858 nt8.61□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 YPT10YBR264C 600 nt8.61□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 ADE16YLR028C 1776 nt8.61□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 NMA2YGR010W 1188 nt8.6□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 HMT1YBR034C 1047 nt8.6□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 NPL6YMR091C 1308 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 SGV1YPR161C 1974 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 PPZ2YDR436W 2133 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 YGL081WYGL081W 963 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 COX16YJL003W 357 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 PET10YKR046C 852 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 YML079WYML079W 606 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 MSI1YBR195C 1269 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 MAS2YHR024C 1449 nt8.59□□□□□ -1.03
SSF2Q12153 DOC1YGL240W 753 nt8.58□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 GUT1YHL032C 2130 nt8.58□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 DAL80YKR034W 810 nt8.58□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 ERV25YML012W 636 nt8.58□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 DSC3YOR223W 879 nt8.57□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 ATP23YNR020C 813 nt8.56□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 HRB1YNL004W 1365 nt8.56□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 MET13YGL125W 1803 nt8.55□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 MDH2YOL126C 1134 nt8.55□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 CDC3YLR314C 1563 nt8.55□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 PMT1YDL095W 2454 nt8.55□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 PEX28YHR150W 1740 nt8.54□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 DUS3YLR401C 2007 nt8.54□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 PIH1YHR034C 1035 nt8.54□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 RCF2YNR018W 675 nt8.54□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 LEO1YOR123C 1395 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 YDR215CYDR215C 414 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 SKP1YDR328C 585 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 PRY2YKR013W 990 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 PAM17YKR065C 594 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 HOG1YLR113W 1308 nt8.53□□□□□ -1.04
SSF2Q12153 RPR1RPR1 369 nt8.52□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 RSC9YML127W 1746 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 ALR1YOL130W 2580 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YCR049CYCR049C 447 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 PUP2YGR253C 783 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 OPI1YHL020C 1215 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 VPS65YLR322W 315 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 CAR2YLR438W 1275 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 CKI1YLR133W 1749 nt8.51□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YBL111CYBL111C 2004 nt8.5□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 PIL1YGR086C 1020 nt8.49□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 ECM10YEL030W 1935 nt8.48□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YPL247CYPL247C 1572 nt8.48□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YHR145CYHR145C 357 nt8.48□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.48□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 ADH6YMR318C 1083 nt8.48□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 PDC5YLR134W 1692 nt8.47□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 BDS1YOL164W 1941 nt8.47□□□□□ -1.05
SSF2Q12153 YOR300WYOR300W 309 nt8.46□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 PFS2YNL317W 1398 nt8.46□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 CIT3YPR001W 1461 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 MDL2YPL270W 2322 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 SLM3YDL033C 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 SNF7YLR025W 723 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 HSV2YGR223C 1347 nt8.45□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 PMT7YDR307W 1989 nt8.44□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 UME1YPL139C 1383 nt8.44□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.43□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 ORM1YGR038W 669 nt8.43□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YML122CYML122C 381 nt8.43□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 PTH2YBL057C 627 nt8.43□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YAH1YPL252C 519 nt8.43□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 SGF73YGL066W 1974 nt8.42□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 SNA3YJL151C 402 nt8.42□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 RUP1YOR138C 2016 nt8.42□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 LAT1YNL071W 1449 nt8.41□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 TRR2YHR106W 1029 nt8.41□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 CCW12YLR110C 402 nt8.41□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YPL067CYPL067C 597 nt8.41□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 RTC2YBR147W 891 nt8.41□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 HAL5YJL165C 2568 nt8.4□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YJL213WYJL213W 996 nt8.4□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 AST1YBL069W 1290 nt8.4□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 YPQ1YOL092W 927 nt8.4□□□□□ -1.06
SSF2Q12153 CYS3YAL012W 1185 nt8.39□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 YOX1YML027W 1158 nt8.39□□□□□ -1.07
SSF2Q12153 PRS4YBL068W 981 nt8.39□□□□□ -1.07
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