Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YJL045WYJL045W 1905 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 TPI1YDR050C 747 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YDR215CYDR215C 414 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 GTS1YGL181W 1191 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 RMA1YKL132C 1293 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 SAM50YNL026W 1455 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 TCB1YOR086C 3561 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 VPS65YLR322W 315 nt7.65□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 UBP13YBL067C 2244 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 RPL12BYDR418W 498 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YJL043WYJL043W 774 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 RCR1YBR005W 642 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 CDC23YHR166C 1881 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 POB3YML069W 1659 nt7.63□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YPC1YBR183W 951 nt7.63□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 STE3YKL178C 1413 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 AQR1YNL065W 1761 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 CKI1YLR133W 1749 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 HNM1YGL077C 1692 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 ERV25YML012W 636 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YNL165WYNL165W 1221 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YDR327WYDR327W 327 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 DAL80YKR034W 810 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 CCR4YAL021C 2514 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 CAN1YEL063C 1773 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YKR018CYKR018C 2178 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 PRB1YEL060C 1908 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YAH1YPL252C 519 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS3Q08438 YHM2YMR241W 945 nt7.58□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 MSS51YLR203C 1311 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YER137CYER137C 447 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YIL168WYIL168W 384 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 APT1YML022W 564 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 INP54YOL065C 1155 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YNL295WYNL295W 1575 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YNL040WYNL040W 1371 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 ERG24YNL280C 1317 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 SEC24YIL109C 2781 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 OPI1YHL020C 1215 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YIL108WYIL108W 2091 nt7.56□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 TOD6YBL054W 1578 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 RRP43YCR035C 1185 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 GET2YER083C 858 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 TDH1YJL052W 999 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 PUP1YOR157C 786 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 FLC2YAL053W 2352 nt7.55□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 UTR5YEL035C 501 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YGL260WYGL260W 231 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 ATO2YNR002C 849 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 SLG1YOR008C 1137 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 RMD8YFR048W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YEL023CYEL023C 2049 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 YKL147CYKL147C 618 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 PRY2YKR013W 990 nt7.53□□□□□ -1.2
VHS3Q08438 BNA3YJL060W 1335 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 STF1YDL130W-A 261 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 HRA1HRA1 564 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 MAS2YHR024C 1449 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 PSP2YML017W 1782 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 SPR1YOR190W 1338 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 HXT13YEL069C 1695 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 AFG3YER017C 2286 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 YPT10YBR264C 600 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 BDS1YOL164W 1941 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 BAP3YDR046C 1815 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 ADA2YDR448W 1305 nt7.5□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 PAM17YKR065C 594 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 SWP1YMR149W 861 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 CPT1YNL130C 1182 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 CMK2YOL016C 1344 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 PPZ2YDR436W 2133 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 SGV1YPR161C 1974 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 ENB1YOL158C 1821 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 MSB3YNL293W 1902 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 YJL211CYJL211C 444 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 GUT1YHL032C 2130 nt7.46□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 PNS1YOR161C 1620 nt7.46□□□□□ -1.21
VHS3Q08438 LOT6YLR011W 576 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 LIP5YOR196C 1245 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 DSC3YOR223W 879 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 AFG2YLR397C 2343 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 EEB1YPL095C 1371 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 PSA1YDL055C 1086 nt7.45□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 YCR041WYCR041W 333 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 TAD2YJL035C 753 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 RFS1YBR052C 633 nt7.44□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 SPS1YDR523C 1473 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 FCY2YER056C 1602 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 STS1YIR011C 960 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 ERV2YPR037C 591 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 YPL277CYPL277C 1464 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 NUP57YGR119C 1626 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 GDH1YOR375C 1365 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 ELP4YPL101W 1371 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 MHP1YJL042W 4197 nt7.41□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 MAK32YCR019W 1092 nt7.41□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 ADH6YMR318C 1083 nt7.4□□□□□ -1.22
VHS3Q08438 CDC3YLR314C 1563 nt7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.5 ms