Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC63Q05C16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC63Q05C16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC63Q05C16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms