Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTK2Q05397 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTK2Q05397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTK2Q05397 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms