Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCQQ04759 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCQQ04759 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms