Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRB3Q04118 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms