Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF8Q02556 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF8Q02556 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRF8Q02556 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms