Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX5Q02548 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX5Q02548 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms