Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD83Q01151 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD83Q01151 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD83Q01151 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD83Q01151 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD83Q01151 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD83Q01151 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD83Q01151 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD83Q01151 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD83Q01151 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD83Q01151 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD83Q01151 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD83Q01151 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD83Q01151 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD83Q01151 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD83Q01151 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD83Q01151 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD83Q01151 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD83Q01151 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD83Q01151 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD83Q01151 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD83Q01151 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CD83Q01151 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD83Q01151 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD83Q01151 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD83Q01151 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD83Q01151 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD83Q01151 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD83Q01151 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD83Q01151 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD83Q01151 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD83Q01151 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD83Q01151 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD83Q01151 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD83Q01151 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD83Q01151 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD83Q01151 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD83Q01151 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD83Q01151 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD83Q01151 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD83Q01151 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD83Q01151 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD83Q01151 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD83Q01151 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD83Q01151 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD83Q01151 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD83Q01151 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD83Q01151 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD83Q01151 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD83Q01151 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD83Q01151 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD83Q01151 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms