Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms