Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKOR1P84550 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKOR1P84550 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms