Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX1P83916 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX1P83916 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX1P83916 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX1P83916 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX1P83916 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX1P83916 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX1P83916 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX1P83916 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX1P83916 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX1P83916 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX1P83916 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX1P83916 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX1P83916 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX1P83916 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX1P83916 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX1P83916 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX1P83916 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX1P83916 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX1P83916 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX1P83916 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX1P83916 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX1P83916 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX1P83916 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX1P83916 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX1P83916 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX1P83916 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX1P83916 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX1P83916 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX1P83916 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX1P83916 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX1P83916 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX1P83916 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX1P83916 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBX1P83916 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBX1P83916 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBX1P83916 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBX1P83916 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBX1P83916 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBX1P83916 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBX1P83916 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBX1P83916 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CBX1P83916 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBX1P83916 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBX1P83916 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBX1P83916 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CBX1P83916 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBX1P83916 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX1P83916 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX1P83916 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX1P83916 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBX1P83916 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBX1P83916 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBX1P83916 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBX1P83916 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBX1P83916 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBX1P83916 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CBX1P83916 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CBX1P83916 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBX1P83916 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBX1P83916 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBX1P83916 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBX1P83916 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBX1P83916 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBX1P83916 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBX1P83916 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBX1P83916 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBX1P83916 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBX1P83916 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBX1P83916 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX1P83916 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX1P83916 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX1P83916 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX1P83916 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX1P83916 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX1P83916 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX1P83916 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms