Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX4P78413 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX4P78413 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX4P78413 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX4P78413 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX4P78413 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX4P78413 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX4P78413 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX4P78413 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX4P78413 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX4P78413 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX4P78413 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX4P78413 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX4P78413 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX4P78413 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX4P78413 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX4P78413 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX4P78413 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX4P78413 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX4P78413 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX4P78413 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX4P78413 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX4P78413 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX4P78413 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX4P78413 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX4P78413 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX4P78413 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX4P78413 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX4P78413 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX4P78413 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX4P78413 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX4P78413 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX4P78413 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX4P78413 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX4P78413 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX4P78413 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX4P78413 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX4P78413 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX4P78413 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX4P78413 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX4P78413 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX4P78413 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX4P78413 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX4P78413 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX4P78413 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX4P78413 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX4P78413 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX4P78413 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX4P78413 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX4P78413 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX4P78413 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX4P78413 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX4P78413 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX4P78413 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX4P78413 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX4P78413 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX4P78413 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX4P78413 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX4P78413 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX4P78413 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX4P78413 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX4P78413 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX4P78413 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX4P78413 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX4P78413 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX4P78413 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX4P78413 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX4P78413 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX4P78413 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX4P78413 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX4P78413 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX4P78413 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX4P78413 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX4P78413 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX4P78413 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX4P78413 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX4P78413 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX4P78413 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX4P78413 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX4P78413 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX4P78413 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX4P78413 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX4P78413 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX4P78413 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX4P78413 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX4P78413 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX4P78413 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX4P78413 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX4P78413 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX4P78413 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX4P78413 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX4P78413 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX4P78413 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX4P78413 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX4P78413 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms