Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEP78395 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEP78395 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms