Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT83P78385 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT83P78385 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT83P78385 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT83P78385 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT83P78385 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT83P78385 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT83P78385 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT83P78385 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT83P78385 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT83P78385 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT83P78385 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT83P78385 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT83P78385 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT83P78385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT83P78385 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT83P78385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT83P78385 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT83P78385 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT83P78385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT83P78385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT83P78385 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT83P78385 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT83P78385 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT83P78385 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT83P78385 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT83P78385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT83P78385 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT83P78385 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT83P78385 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT83P78385 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT83P78385 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT83P78385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT83P78385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT83P78385 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT83P78385 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT83P78385 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT83P78385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT83P78385 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT83P78385 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT83P78385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT83P78385 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT83P78385 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT83P78385 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT83P78385 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT83P78385 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT83P78385 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT83P78385 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT83P78385 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT83P78385 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT83P78385 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT83P78385 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT83P78385 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT83P78385 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT83P78385 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT83P78385 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT83P78385 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT83P78385 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT83P78385 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT83P78385 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT83P78385 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT83P78385 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT83P78385 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT83P78385 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT83P78385 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT83P78385 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT83P78385 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT83P78385 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT83P78385 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT83P78385 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT83P78385 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT83P78385 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT83P78385 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT83P78385 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT83P78385 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT83P78385 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT83P78385 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT83P78385 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT83P78385 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT83P78385 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms