Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASIC1P78348 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASIC1P78348 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms