Protein–RNA interactions for Protein: P78332

RBM6, RNA-binding protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM6P78332 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RBM6P78332 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RBM6P78332 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RBM6P78332 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RBM6P78332 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM6P78332 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM6P78332 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM6P78332 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM6P78332 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM6P78332 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RBM6P78332 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RBM6P78332 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RBM6P78332 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM6P78332 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RBM6P78332 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RBM6P78332 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RBM6P78332 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RBM6P78332 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM6P78332 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM6P78332 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM6P78332 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM6P78332 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM6P78332 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBM6P78332 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RBM6P78332 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RBM6P78332 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RBM6P78332 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RBM6P78332 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RBM6P78332 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RBM6P78332 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM6P78332 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM6P78332 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM6P78332 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM6P78332 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RBM6P78332 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RBM6P78332 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RBM6P78332 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RBM6P78332 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RBM6P78332 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM6P78332 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBM6P78332 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBM6P78332 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM6P78332 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM6P78332 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RBM6P78332 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RBM6P78332 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RBM6P78332 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RBM6P78332 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RBM6P78332 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RBM6P78332 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM6P78332 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM6P78332 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM6P78332 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RBM6P78332 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RBM6P78332 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RBM6P78332 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RBM6P78332 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RBM6P78332 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RBM6P78332 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM6P78332 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM6P78332 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM6P78332 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM6P78332 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM6P78332 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM6P78332 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM6P78332 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM6P78332 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM6P78332 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM6P78332 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM6P78332 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM6P78332 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM6P78332 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM6P78332 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM6P78332 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM6P78332 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RBM6P78332 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms