Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPHP78330 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPHP78330 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPHP78330 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPHP78330 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPHP78330 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPHP78330 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPHP78330 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPHP78330 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPHP78330 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPHP78330 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPHP78330 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSPHP78330 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSPHP78330 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPHP78330 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPHP78330 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPHP78330 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPHP78330 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPHP78330 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPHP78330 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPHP78330 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPHP78330 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPHP78330 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPHP78330 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPHP78330 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPHP78330 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPHP78330 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPHP78330 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPHP78330 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSPHP78330 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSPHP78330 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSPHP78330 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSPHP78330 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSPHP78330 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSPHP78330 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSPHP78330 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSPHP78330 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSPHP78330 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSPHP78330 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSPHP78330 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSPHP78330 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSPHP78330 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSPHP78330 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSPHP78330 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSPHP78330 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSPHP78330 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSPHP78330 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSPHP78330 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSPHP78330 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSPHP78330 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPHP78330 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms