Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM193AP78312 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM193AP78312 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM193AP78312 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms