Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBB4BP68371 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB4BP68371 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4BP68371 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4BP68371 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms