Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SUMO1P63165 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUMO1P63165 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms