Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS13P62277 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS13P62277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS13P62277 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS13P62277 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS13P62277 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS13P62277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS13P62277 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS13P62277 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS13P62277 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS13P62277 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS13P62277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS13P62277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS13P62277 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS13P62277 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS13P62277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS13P62277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS13P62277 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS13P62277 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS13P62277 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS13P62277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS13P62277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS13P62277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS13P62277 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS13P62277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS13P62277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS13P62277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS13P62277 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS13P62277 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS13P62277 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS13P62277 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS13P62277 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS13P62277 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS13P62277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS13P62277 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS13P62277 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS13P62277 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS13P62277 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS13P62277 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS13P62277 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS13P62277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS13P62277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS13P62277 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS13P62277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS13P62277 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS13P62277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS13P62277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS13P62277 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS13P62277 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms