Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS23P62266 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS23P62266 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS23P62266 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS23P62266 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS23P62266 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS23P62266 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS23P62266 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS23P62266 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS23P62266 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS23P62266 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS23P62266 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS23P62266 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS23P62266 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS23P62266 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS23P62266 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS23P62266 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS23P62266 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS23P62266 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS23P62266 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS23P62266 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS23P62266 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS23P62266 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS23P62266 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS23P62266 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS23P62266 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS23P62266 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS23P62266 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS23P62266 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS23P62266 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS23P62266 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS23P62266 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS23P62266 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS23P62266 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS23P62266 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS23P62266 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS23P62266 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS23P62266 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS23P62266 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS23P62266 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms