Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA1P59665 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA1P59665 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DEFA1P59665 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA1P59665 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms