Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB15P59190 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB15P59190 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB15P59190 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB15P59190 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB15P59190 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB15P59190 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB15P59190 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB15P59190 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB15P59190 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB15P59190 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB15P59190 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB15P59190 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB15P59190 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB15P59190 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB15P59190 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB15P59190 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB15P59190 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB15P59190 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB15P59190 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB15P59190 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB15P59190 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB15P59190 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB15P59190 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB15P59190 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB15P59190 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB15P59190 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB15P59190 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB15P59190 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB15P59190 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB15P59190 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB15P59190 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB15P59190 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB15P59190 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB15P59190 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB15P59190 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB15P59190 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB15P59190 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB15P59190 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB15P59190 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB15P59190 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB15P59190 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB15P59190 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB15P59190 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB15P59190 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB15P59190 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB15P59190 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB15P59190 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB15P59190 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB15P59190 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB15P59190 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB15P59190 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB15P59190 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB15P59190 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB15P59190 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB15P59190 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB15P59190 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms