Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM11AP58511 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM11AP58511 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM11AP58511 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM11AP58511 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms