Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL3P58215 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LOXL3P58215 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL3P58215 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms