Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXW4P57775 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW4P57775 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW4P57775 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW4P57775 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms