Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSCP56915 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSCP56915 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSCP56915 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSCP56915 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSCP56915 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSCP56915 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSCP56915 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSCP56915 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSCP56915 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSCP56915 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSCP56915 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSCP56915 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSCP56915 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSCP56915 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSCP56915 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSCP56915 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSCP56915 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSCP56915 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSCP56915 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSCP56915 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSCP56915 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSCP56915 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSCP56915 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSCP56915 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSCP56915 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GSCP56915 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSCP56915 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSCP56915 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSCP56915 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSCP56915 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSCP56915 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSCP56915 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSCP56915 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSCP56915 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSCP56915 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSCP56915 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GSCP56915 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSCP56915 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSCP56915 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSCP56915 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSCP56915 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSCP56915 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSCP56915 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSCP56915 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSCP56915 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSCP56915 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSCP56915 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GSCP56915 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSCP56915 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSCP56915 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSCP56915 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSCP56915 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSCP56915 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSCP56915 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSCP56915 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSCP56915 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSCP56915 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSCP56915 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSCP56915 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSCP56915 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSCP56915 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSCP56915 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSCP56915 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms