Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PER3P56645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PER3P56645 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PER3P56645 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PER3P56645 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PER3P56645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PER3P56645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PER3P56645 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PER3P56645 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PER3P56645 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PER3P56645 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PER3P56645 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PER3P56645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PER3P56645 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PER3P56645 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PER3P56645 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PER3P56645 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PER3P56645 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PER3P56645 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PER3P56645 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PER3P56645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PER3P56645 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PER3P56645 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PER3P56645 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PER3P56645 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PER3P56645 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PER3P56645 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PER3P56645 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PER3P56645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PER3P56645 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PER3P56645 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PER3P56645 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PER3P56645 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PER3P56645 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PER3P56645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PER3P56645 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PER3P56645 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PER3P56645 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PER3P56645 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PER3P56645 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PER3P56645 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PER3P56645 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PER3P56645 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PER3P56645 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PER3P56645 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PER3P56645 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PER3P56645 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PER3P56645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PER3P56645 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PER3P56645 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PER3P56645 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PER3P56645 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PER3P56645 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PER3P56645 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PER3P56645 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PER3P56645 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PER3P56645 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PER3P56645 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PER3P56645 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PER3P56645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PER3P56645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PER3P56645 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PER3P56645 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PER3P56645 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PER3P56645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PER3P56645 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PER3P56645 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PER3P56645 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PER3P56645 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PER3P56645 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PER3P56645 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PER3P56645 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PER3P56645 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PER3P56645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms