Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM50BP56557 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM50BP56557 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM50BP56557 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM50BP56557 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM50BP56557 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM50BP56557 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM50BP56557 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM50BP56557 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM50BP56557 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM50BP56557 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM50BP56557 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM50BP56557 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM50BP56557 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM50BP56557 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM50BP56557 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM50BP56557 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM50BP56557 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM50BP56557 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM50BP56557 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM50BP56557 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM50BP56557 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM50BP56557 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM50BP56557 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM50BP56557 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM50BP56557 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms