Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC13P55735 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC13P55735 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC13P55735 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC13P55735 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC13P55735 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC13P55735 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC13P55735 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC13P55735 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC13P55735 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC13P55735 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC13P55735 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC13P55735 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC13P55735 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC13P55735 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC13P55735 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC13P55735 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC13P55735 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC13P55735 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC13P55735 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC13P55735 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC13P55735 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC13P55735 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC13P55735 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC13P55735 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC13P55735 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC13P55735 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC13P55735 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC13P55735 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC13P55735 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC13P55735 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC13P55735 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC13P55735 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC13P55735 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC13P55735 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC13P55735 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC13P55735 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC13P55735 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC13P55735 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC13P55735 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC13P55735 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC13P55735 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC13P55735 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC13P55735 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC13P55735 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC13P55735 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC13P55735 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC13P55735 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC13P55735 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC13P55735 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC13P55735 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC13P55735 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC13P55735 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms