Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MVDP53602 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVDP53602 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVDP53602 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVDP53602 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVDP53602 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVDP53602 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVDP53602 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVDP53602 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVDP53602 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVDP53602 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVDP53602 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVDP53602 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVDP53602 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVDP53602 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVDP53602 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVDP53602 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVDP53602 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVDP53602 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVDP53602 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVDP53602 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVDP53602 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVDP53602 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVDP53602 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVDP53602 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVDP53602 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVDP53602 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVDP53602 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVDP53602 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVDP53602 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVDP53602 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVDP53602 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MVDP53602 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVDP53602 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MVDP53602 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MVDP53602 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVDP53602 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVDP53602 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVDP53602 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVDP53602 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVDP53602 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVDP53602 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVDP53602 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVDP53602 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVDP53602 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVDP53602 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVDP53602 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVDP53602 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVDP53602 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVDP53602 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVDP53602 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVDP53602 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MVDP53602 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MVDP53602 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MVDP53602 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVDP53602 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVDP53602 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVDP53602 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MVDP53602 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MVDP53602 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MVDP53602 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MVDP53602 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVDP53602 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVDP53602 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVDP53602 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MVDP53602 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVDP53602 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVDP53602 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVDP53602 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVDP53602 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVDP53602 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVDP53602 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVDP53602 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVDP53602 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVDP53602 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVDP53602 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms