Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOSBP53539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOSBP53539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOSBP53539 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOSBP53539 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FOSBP53539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FOSBP53539 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FOSBP53539 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOSBP53539 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOSBP53539 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOSBP53539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOSBP53539 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOSBP53539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOSBP53539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOSBP53539 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOSBP53539 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOSBP53539 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOSBP53539 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOSBP53539 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOSBP53539 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOSBP53539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOSBP53539 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOSBP53539 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOSBP53539 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
FOSBP53539 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOSBP53539 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOSBP53539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOSBP53539 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOSBP53539 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOSBP53539 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOSBP53539 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOSBP53539 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOSBP53539 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOSBP53539 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOSBP53539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOSBP53539 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOSBP53539 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOSBP53539 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOSBP53539 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOSBP53539 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOSBP53539 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOSBP53539 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOSBP53539 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOSBP53539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOSBP53539 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOSBP53539 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOSBP53539 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOSBP53539 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOSBP53539 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOSBP53539 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOSBP53539 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOSBP53539 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOSBP53539 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOSBP53539 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOSBP53539 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOSBP53539 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOSBP53539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOSBP53539 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOSBP53539 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOSBP53539 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOSBP53539 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOSBP53539 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOSBP53539 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOSBP53539 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOSBP53539 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FOSBP53539 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSBP53539 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOSBP53539 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOSBP53539 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOSBP53539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOSBP53539 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSBP53539 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSBP53539 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSBP53539 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms