Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGDP52209 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGDP52209 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGDP52209 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGDP52209 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGDP52209 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGDP52209 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGDP52209 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGDP52209 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGDP52209 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGDP52209 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGDP52209 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGDP52209 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGDP52209 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGDP52209 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGDP52209 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGDP52209 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGDP52209 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGDP52209 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGDP52209 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGDP52209 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGDP52209 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGDP52209 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGDP52209 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGDP52209 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGDP52209 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGDP52209 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGDP52209 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGDP52209 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGDP52209 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGDP52209 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGDP52209 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGDP52209 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGDP52209 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGDP52209 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGDP52209 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGDP52209 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGDP52209 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGDP52209 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGDP52209 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGDP52209 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGDP52209 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PGDP52209 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGDP52209 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGDP52209 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGDP52209 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGDP52209 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGDP52209 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PGDP52209 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGDP52209 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGDP52209 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGDP52209 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGDP52209 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGDP52209 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGDP52209 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGDP52209 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGDP52209 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGDP52209 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGDP52209 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGDP52209 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGDP52209 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGDP52209 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGDP52209 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGDP52209 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGDP52209 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGDP52209 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGDP52209 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGDP52209 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGDP52209 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGDP52209 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGDP52209 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGDP52209 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGDP52209 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms