Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA3P51812 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA3P51812 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA3P51812 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms