Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK7P50613 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK7P50613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK7P50613 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK7P50613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK7P50613 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK7P50613 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK7P50613 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK7P50613 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK7P50613 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK7P50613 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK7P50613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK7P50613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK7P50613 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK7P50613 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK7P50613 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK7P50613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK7P50613 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK7P50613 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK7P50613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK7P50613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK7P50613 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK7P50613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK7P50613 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK7P50613 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK7P50613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK7P50613 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK7P50613 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK7P50613 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK7P50613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK7P50613 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK7P50613 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK7P50613 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK7P50613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK7P50613 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK7P50613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK7P50613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK7P50613 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK7P50613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK7P50613 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK7P50613 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK7P50613 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK7P50613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK7P50613 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK7P50613 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK7P50613 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK7P50613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK7P50613 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK7P50613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK7P50613 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK7P50613 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK7P50613 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK7P50613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK7P50613 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK7P50613 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK7P50613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK7P50613 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK7P50613 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK7P50613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK7P50613 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK7P50613 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK7P50613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK7P50613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK7P50613 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK7P50613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK7P50613 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK7P50613 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK7P50613 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK7P50613 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK7P50613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK7P50613 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK7P50613 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK7P50613 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK7P50613 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK7P50613 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK7P50613 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK7P50613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK7P50613 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms