Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GATMP50440 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GATMP50440 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GATMP50440 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GATMP50440 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GATMP50440 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GATMP50440 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GATMP50440 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATMP50440 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GATMP50440 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATMP50440 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATMP50440 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GATMP50440 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GATMP50440 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GATMP50440 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GATMP50440 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GATMP50440 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GATMP50440 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GATMP50440 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GATMP50440 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GATMP50440 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GATMP50440 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GATMP50440 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GATMP50440 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATMP50440 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GATMP50440 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GATMP50440 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GATMP50440 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GATMP50440 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GATMP50440 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATMP50440 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GATMP50440 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATMP50440 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATMP50440 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATMP50440 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATMP50440 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATMP50440 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATMP50440 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATMP50440 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATMP50440 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATMP50440 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GATMP50440 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GATMP50440 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GATMP50440 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GATMP50440 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GATMP50440 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATMP50440 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATMP50440 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATMP50440 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATMP50440 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATMP50440 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GATMP50440 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GATMP50440 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GATMP50440 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GATMP50440 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GATMP50440 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GATMP50440 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GATMP50440 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GATMP50440 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GATMP50440 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GATMP50440 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GATMP50440 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GATMP50440 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GATMP50440 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GATMP50440 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GATMP50440 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GATMP50440 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATMP50440 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATMP50440 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATMP50440 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATMP50440 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GATMP50440 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GATMP50440 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GATMP50440 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GATMP50440 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATMP50440 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATMP50440 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms