Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK3P49761 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK3P49761 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK3P49761 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK3P49761 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK3P49761 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK3P49761 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK3P49761 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK3P49761 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK3P49761 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK3P49761 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK3P49761 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK3P49761 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK3P49761 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK3P49761 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK3P49761 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK3P49761 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK3P49761 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK3P49761 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLK3P49761 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLK3P49761 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLK3P49761 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK3P49761 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK3P49761 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK3P49761 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK3P49761 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK3P49761 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK3P49761 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK3P49761 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK3P49761 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK3P49761 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK3P49761 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK3P49761 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK3P49761 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK3P49761 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK3P49761 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK3P49761 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK3P49761 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK3P49761 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK3P49761 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK3P49761 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK3P49761 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK3P49761 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK3P49761 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK3P49761 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK3P49761 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK3P49761 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK3P49761 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK3P49761 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK3P49761 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK3P49761 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK3P49761 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK3P49761 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms