Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN1P49257 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN1P49257 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN1P49257 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms