Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPIAP49247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPIAP49247 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPIAP49247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPIAP49247 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPIAP49247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPIAP49247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPIAP49247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPIAP49247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPIAP49247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPIAP49247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPIAP49247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPIAP49247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPIAP49247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPIAP49247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPIAP49247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPIAP49247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPIAP49247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPIAP49247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPIAP49247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPIAP49247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPIAP49247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPIAP49247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPIAP49247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPIAP49247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPIAP49247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPIAP49247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RPIAP49247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPIAP49247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPIAP49247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPIAP49247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPIAP49247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPIAP49247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPIAP49247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPIAP49247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPIAP49247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPIAP49247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPIAP49247 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPIAP49247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPIAP49247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPIAP49247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPIAP49247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPIAP49247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPIAP49247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPIAP49247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPIAP49247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPIAP49247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPIAP49247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPIAP49247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPIAP49247 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPIAP49247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPIAP49247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPIAP49247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPIAP49247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPIAP49247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPIAP49247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPIAP49247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPIAP49247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms